MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosococcus watsoni C-113 plasmid pNWAT02

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014317	CAT	2	6	51	56	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014317	CTC	2	6	109	114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014317	GCC	2	6	122	127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014317	CGG	2	6	166	171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014317	GGC	2	6	179	184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014317	TGG	2	6	226	231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014317	CTGCG	2	10	251	260	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_014317	CTT	2	6	339	344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014317	CCG	2	6	436	441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014317	CCG	2	6	456	461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_014317	GCC	2	6	731	736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_014317	CCG	2	6	742	747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_014317	CAA	2	6	762	767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014317	CGG	2	6	870	875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014317	GCCCG	2	10	1005	1014	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_014317	GCC	3	9	1022	1030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014317	CCA	2	6	1085	1090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_014317	CGC	2	6	1113	1118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_014317	G	6	6	1128	1133	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014317	G	6	6	1142	1147	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014317	CGG	2	6	1156	1161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014317	GCC	2	6	1166	1171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014317	GTC	2	6	1177	1182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014317	GGC	2	6	1191	1196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014317	GCC	2	6	1273	1278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014317	ACCTC	2	10	1341	1350	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_014317	A	6	6	1386	1391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014317	GGAT	2	8	1452	1459	25 %	25 %	50 %	0 %	300067538
29	NC_014317	CTA	2	6	1469	1474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300067538
30	NC_014317	CCG	2	6	1521	1526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300067538
31	NC_014317	GAA	2	6	1528	1533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300067538
32	NC_014317	CTT	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300067538
33	NC_014317	ACA	2	6	1572	1577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300067538
34	NC_014317	ATT	2	6	1779	1784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300067538
35	NC_014317	A	7	7	1794	1800	100 %	0 %	0 %	0 %	300067538
36	NC_014317	GA	3	6	1890	1895	50 %	0 %	50 %	0 %	300067538
37	NC_014317	AC	4	8	1922	1929	50 %	0 %	0 %	50 %	300067538
38	NC_014317	T	6	6	1936	1941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014317	TCCA	2	8	1958	1965	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014317	T	7	7	1978	1984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014317	AGGC	2	8	2096	2103	25 %	0 %	50 %	25 %	300067539
42	NC_014317	TGC	2	6	2152	2157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067539
43	NC_014317	GAA	2	6	2175	2180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300067539
44	NC_014317	GCC	2	6	2218	2223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300067539
45	NC_014317	GCC	2	6	2400	2405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014317	T	6	6	2416	2421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014317	CGC	2	6	2442	2447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014317	ATT	2	6	2469	2474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014317	CA	3	6	2802	2807	50 %	0 %	0 %	50 %	300067540
50	NC_014317	GGGT	2	8	2820	2827	0 %	25 %	75 %	0 %	300067540
51	NC_014317	AATC	2	8	2866	2873	50 %	25 %	0 %	25 %	300067541
52	NC_014317	TGC	2	6	3076	3081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067541
53	NC_014317	CAAA	2	8	3169	3176	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014317	CGC	2	6	3230	3235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014317	GAG	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014317	ACC	2	6	3334	3339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014317	CAAG	2	8	3404	3411	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014317	GAT	2	6	3481	3486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014317	ACT	2	6	3565	3570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014317	CT	3	6	3569	3574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014317	T	6	6	3598	3603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014317	GGCG	2	8	3642	3649	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014317	A	6	6	3729	3734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014317	TCA	2	6	3742	3747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014317	GAG	2	6	3787	3792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014317	G	6	6	3792	3797	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014317	G	6	6	3820	3825	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014317	GC	3	6	3887	3892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014317	CG	3	6	3955	3960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014317	A	6	6	3991	3996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014317	AAAT	2	8	4019	4026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014317	T	8	8	4040	4047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014317	TGCC	2	8	4071	4078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014317	CCTA	2	8	4095	4102	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014317	CCTA	2	8	4117	4124	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014317	TGCC	2	8	4137	4144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014317	CCTA	2	8	4161	4168	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014317	T	6	6	4188	4193	0 %	100 %	0 %	0 %	300067542
79	NC_014317	GCTG	2	8	4223	4230	0 %	25 %	50 %	25 %	300067542
80	NC_014317	CAC	2	6	4245	4250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300067542
81	NC_014317	CAG	2	6	4368	4373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300067542
82	NC_014317	TTCC	2	8	4470	4477	0 %	50 %	0 %	50 %	300067542
83	NC_014317	AATC	2	8	4478	4485	50 %	25 %	0 %	25 %	300067542
84	NC_014317	TCAA	2	8	4576	4583	50 %	25 %	0 %	25 %	300067542
85	NC_014317	ACG	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300067542
86	NC_014317	CATG	2	8	4664	4671	25 %	25 %	25 %	25 %	300067542
87	NC_014317	A	6	6	4702	4707	100 %	0 %	0 %	0 %	300067542
88	NC_014317	TGC	2	6	4744	4749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067542
89	NC_014317	CA	3	6	4774	4779	50 %	0 %	0 %	50 %	300067542
90	NC_014317	AAC	2	6	4891	4896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300067542
91	NC_014317	GCT	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067542
92	NC_014317	CTG	2	6	4982	4987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067542
93	NC_014317	CTT	2	6	5015	5020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300067542
94	NC_014317	GGC	2	6	5033	5038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300067542
95	NC_014317	CTG	2	6	5080	5085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014317	TGCCT	2	10	5105	5114	0 %	40 %	20 %	40 %	300067543
97	NC_014317	TGC	2	6	5120	5125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067543
98	NC_014317	GCT	2	6	5155	5160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067543
99	NC_014317	TGC	2	6	5205	5210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067543
100	NC_014317	GCC	2	6	5260	5265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300067543
101	NC_014317	TGT	2	6	5277	5282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300067543
102	NC_014317	GCA	2	6	5287	5292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300067543
103	NC_014317	TGCC	2	8	5362	5369	0 %	25 %	25 %	50 %	300067543
104	NC_014317	T	6	6	5448	5453	0 %	100 %	0 %	0 %	300067543
105	NC_014317	GTT	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300067543
106	NC_014317	CTG	2	6	5506	5511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067543

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.